Новини генетики

    Метод полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) спрямований на виявлення кишкових паразитів може бути використаний для дослідження фекальних зразків ДНК та покращення  якості виявлення патогенних організмів.
   
     Складний ПЛР-аналіз для виявлення яєць і паразитів у випорожненнях тепер доступний, молекулярна технологія при цьому порівнюється з мікроскопією та системою виявлення копро- антигену.

    Вчені Університету Вірджинії (Шарлоттсвілль, Вірджинія, США), адаптували декілька існуючих в реальному часі ПЛР аналізів у пропускний протокол основних кишкових паразитів. Фекальні ДНК зразки були отримані від 192 дітей дошкільного віку та молодшого віку з Бангладешу і 190 зразків з Медичного центру Лейденського університету (Leiden, Нідерланди). Матеріали позитивного контролю були включені в це дослідження. Аналіз включає в себе дві мультиплексні ПЛР реакції, одна з особливими праймерами для найпростіших і одна для гельмінтів, після чого продукти ПЛР гібридизуються в крапельки пов'язані з внутрішнім олігонуклеотидним зондом і досліджуються на платформі Luminex (Luminex корпорації, Austin, TX , США).

 

   Luminex-аналіз найпростіших показав низьку межу виявлення 1000 кишкових лямблій, 100 ооцист Cryptosporidium parvum, і 10 дизентерійних амеб у 200 мг зразка калу. Luminex аналіз гельмінтів допомагає виявити анкілостоми (Ancylostoma duodenale), людські аскариди, Necator Americanus, і Strongyloides stericoralis в дуже низьких концентраціях (кількостях). У порівнянні з першим мультиплексним аналізом ПЛР в режимі реального часу, цей ПЛР аналіз крапельок має чутливість між 83% і 100% та специфічність 319 клінічних зразків.

 

    Автори прийшли до висновку, що мультиплексний крапельний ПЛР протокол забезпечує альтернативну високу пропускну здатність платформи для молекулярної діагностики для специфічного та чутливого виявлення декількох основних кишкових паразитів і є потенційною альтернативою мікроскопії для лабораторій. Дослідження було опубліковане в лютому 2011 року, в американському журналі «Tropical Medicine and Hygiene».

    Джерело